臨床工学課は、おもに臨床部門と機器管理部門の2つの部門に分かれ業務を行っています。
臨床部門では、医師の指示のもと生命を維持・管理する装置（生命維持管理装置）、主要臓器の働きを代替する人工臓器、病的な症状を緩和する治療装置や移植関連装置、手術中に神経の機能検査機器装置などの、準備・操作・管理を行っています。また、内視鏡検査・治療の医師介助も行っています。
管理部門では、院内で日常的に使用している輸液ポンプやシリンジポンプなど、治療をサポートする医療機器を、いつでも安全に使用できるように、 医療機器管理室で中央管理しています。また、手術支援ロボット「DAVINCI Xi」システムや、内視鏡装置、内視鏡カメラなどの管理・運用を行っています。
